《白虎队》以幕府时代末期为背景，讲述一班由少年组成的战斗部队的悲惨遭遇。历史记载, 小部分白虎队成员以战死或自杀收场，而山下扮演的队员酒井峰治则是少数的生还者，角色在自杀之前碰到一只小狗，最后选择了艰苦地生存下去。 　酒井新太郎（山下智久）是一个典型的日本现代男孩。也不好好的和人打招呼。对这样一个连父母将的话也不会好好听的新太郎，从会津来东京的祖母敏子（野际阳子）生气了。“让我来给你们好好讲讲会津魂是什么。”在敏子面前抬不起头的新太郎和朋友篠田雄介一起逃走了。躲到了他们觉得最安全的会津。身为白虎队战士的后人的2人虽然对于“会津魂”和“白虎队”着两个词语感到非常的厌烦，但是还是利用空闲时间自己来到了白虎队纪念馆看到了和自己非常相似的少年们的照片。2人的思绪回到了遥远的幕府末期……1862年，酒井峰治（山下智久）进入会津藩校日新馆学习。意气昂扬的去专门教导士族弟子们会津武士的要义的日新馆的峰治。母亲阿茂（药师丸博子）也对这样的峰治说着“要牢记要努力成为一个有用的武士，有一天能为光荣的死去”送他出门。除了峰治以外篠田仪三郎（田中圣）伊东又八（藤ケ谷太辅）等以后成为了白虎队战士的少年门都进入了日新馆学习。这个时候，会津藩主松平容保（东山纪之）也被幕府派过来负责守卫京都。这个虽然证明了幕府政府对他的信任，但在尊攘运动横行的京都，与倒幕派诸藩候为敌也是非常危险的尽管他的左右有反对的人，容保还是勇敢接受了任务 但是，时局非常的动乱，最终京城的动乱也蔓延到了会津。在这种时局下，峰治、仪三郎、又八他们的命运也发生了很大的变化。